Blu vive insieme a Jewell e ai loro tre piccoli una vita tranquilla nella coloratissima Rio. Ma Jewel pensa che i loro figli debbano imparara a vivere da uccelli liberi e così insiste affinché tutta la famiglia si avventuri nel cuore dell’Amazzonia. Qui Blu non solo dovrà cercare di andare d’accordo con i nuovi vicini, ma anche lottare contro il timore di perdere Jewell e i ragazzi, affascinati dal richiamo della natura.